Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gjb2Q00977 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gjb2Q00977 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Gjb2Q00977 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms