Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Rbp1Q00915 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rbp1Q00915 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms