Protein–RNA interactions for Protein: P97927

Lama4, Laminin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama4P97927 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama4P97927 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Lama4P97927 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama4P97927 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lama4P97927 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lama4P97927 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms