Protein–RNA interactions for Protein: P97769

Cited1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited1P97769 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Cited1P97769 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited1P97769 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Cited1P97769 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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