Protein–RNA interactions for Protein: P97459

Npas1, Neuronal PAS domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas1P97459 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Npas1P97459 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas1P97459 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Npas1P97459 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms