Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Mesp1P97309 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mesp1P97309 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms