Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Msx3P70354 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx3P70354 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Msx3P70354 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms