Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gfi1P70338 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gfi1P70338 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms