Protein–RNA interactions for Protein: P68134

Acta1, Actin, alpha skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta1P68134 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Acta1P68134 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Acta1P68134 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms