Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gnb1P62874 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gnb1P62874 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms