Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rab3cP62823 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rab3cP62823 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab3cP62823 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms