Protein–RNA interactions for Protein: P62515

Pou3f4, POU domain, class 3, transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f4P62515 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pou3f4P62515 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pou3f4P62515 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms