Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Vbp1P61759 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vbp1P61759 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms