Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme3P61290 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Psme3P61290 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Psme3P61290 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Psme3P61290 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms