Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Sem1P60897 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Sem1P60897 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sem1P60897 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sem1P60897 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sem1P60897 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms