Protein–RNA interactions for Protein: P59326

Ythdf1, YTH domain-containing family protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf1P59326 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ythdf1P59326 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ythdf1P59326 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ythdf1P59326 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ythdf1P59326 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms