Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CgnP59242 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CgnP59242 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CgnP59242 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CgnP59242 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CgnP59242 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CgnP59242 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CgnP59242 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CgnP59242 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CgnP59242 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CgnP59242 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CgnP59242 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CgnP59242 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CgnP59242 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CgnP59242 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CgnP59242 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CgnP59242 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CgnP59242 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CgnP59242 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CgnP59242 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CgnP59242 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CgnP59242 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CgnP59242 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CgnP59242 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CgnP59242 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CgnP59242 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CgnP59242 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms