Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Nup43P59235 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Nup43P59235 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms