Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Strn4P58404 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Strn4P58404 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Strn4P58404 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Strn4P58404 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms