Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Dpf3P58269 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Dpf3P58269 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Dpf3P58269 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms