Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gsc2P56916 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gsc2P56916 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms