Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp5P56399 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp5P56399 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms