Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PitpnbP53811 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PitpnbP53811 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms