Protein–RNA interactions for Protein: P52800

Efnb2, Ephrin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb2P52800 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Efnb2P52800 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb2P52800 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb2P52800 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb2P52800 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb2P52800 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Efnb2P52800 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb2P52800 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb2P52800 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms