Protein–RNA interactions for Protein: P52479

Usp10, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 10, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp10P52479 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp10P52479 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp10P52479 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp10P52479 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms