Protein–RNA interactions for Protein: P50462

Csrp3, Cysteine and glycine-rich protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrp3P50462 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Csrp3P50462 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Csrp3P50462 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms