Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ercc3P49135 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ercc3P49135 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms