Protein–RNA interactions for Protein: P48299

Edn3, Endothelin-3, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn3P48299 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Edn3P48299 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Edn3P48299 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms