Protein–RNA interactions for Protein: P48031

Gbx2, Homeobox protein GBX-2, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbx2P48031 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbx2P48031 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Gbx2P48031 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms