Protein–RNA interactions for Protein: P47937

Tacr3, Neuromedin-K receptor, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr3P47937 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tacr3P47937 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tacr3P47937 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms