Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gli1P47806 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gli1P47806 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms