Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SrprbP47758 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SrprbP47758 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms