Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cdkn1bP46414 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms