Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NodalP43021 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NodalP43021 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NodalP43021 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NodalP43021 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NodalP43021 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
NodalP43021 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
NodalP43021 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms