Protein–RNA interactions for Protein: P41969

Elk1, ETS domain-containing protein Elk-1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk1P41969 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Elk1P41969 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Elk1P41969 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms