Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Csf3rP40223 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Csf3rP40223 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms