Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TpoP35419 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TpoP35419 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
TpoP35419 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
TpoP35419 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
TpoP35419 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TpoP35419 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
TpoP35419 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TpoP35419 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TpoP35419 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TpoP35419 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TpoP35419 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TpoP35419 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TpoP35419 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms