Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rab17P35292 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rab17P35292 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rab17P35292 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms