Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab3dP35276 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rab3dP35276 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rab3dP35276 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms