Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Saa4P31532 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Saa4P31532 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms