Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hoxa11P31311 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa11P31311 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms