Protein–RNA interactions for Protein: P29758

Oat, Ornithine aminotransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OatP29758 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OatP29758 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OatP29758 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OatP29758 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OatP29758 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OatP29758 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OatP29758 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OatP29758 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OatP29758 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
OatP29758 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
OatP29758 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
OatP29758 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OatP29758 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OatP29758 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
OatP29758 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
OatP29758 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OatP29758 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OatP29758 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OatP29758 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
OatP29758 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
OatP29758 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
OatP29758 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
OatP29758 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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