Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tgfb2P27090 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Tgfb2P27090 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tgfb2P27090 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms