Protein–RNA interactions for Protein: P26638

Sars, Serine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarsP26638 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SarsP26638 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SarsP26638 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SarsP26638 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SarsP26638 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SarsP26638 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SarsP26638 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SarsP26638 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SarsP26638 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SarsP26638 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SarsP26638 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SarsP26638 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SarsP26638 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SarsP26638 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SarsP26638 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SarsP26638 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SarsP26638 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SarsP26638 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SarsP26638 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SarsP26638 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SarsP26638 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SarsP26638 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SarsP26638 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SarsP26638 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms