Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ChgaP26339 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ChgaP26339 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ChgaP26339 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ChgaP26339 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms