Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd247P24161 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cd247P24161 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd247P24161 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd247P24161 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms