Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hoxd12P23812 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Hoxd12P23812 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms