Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ggta1P23336 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ggta1P23336 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ggta1P23336 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ggta1P23336 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ggta1P23336 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ggta1P23336 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ggta1P23336 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ggta1P23336 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms