Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pou5f1P20263 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Pou5f1P20263 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms