Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ntf3P20181 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ntf3P20181 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms